DEM Parti’ye ilişkin sözleri tartışma yaratan Köksal, yüzde 50,73 oranında oy alarak Afyonkarahisar Belediye Başkanlığı'na seçildi. Köksal, görevi devraldıktan 1 gün sonra eski CHP Genel Başkanı Kemal Kılıçdaroğlu'yla buluştu. Köksal fotoğrafa "Siyasette üzerimde emeği çok olan tecrübelerinden her zaman yararlandığımız 7. Genel Başkanımız Sayın Kemal Kılıçdaroğlu'nu ziyaret ettim" notu düştü.
Tartışma yaratan açıklamaların peşinden gazeteci Fatih Portakal, Burcu Köksal'ın Kemal Kılıçdaroğlu'na yakın bir isim olmasını vurgulamıştı. Seçimlere az bir süre kala yapılan bu çıkışın kasıtlı olduğunu düşündüğünü ifade eden Portakal, "Talimatı Kılıçdaroğlu'ndan aldığını düşünüyorum' demişti: "Ben bunun bir emirle yapıldığını düşünüyorum. Açık açık net adını de söyleyeyim Kılıçdaroğlu'nun yakınındaki adlardan biri. Birazdan bir görüntü de ekrana getireceğim. Özgür Özel de kendisini Kılıçdaroğlu'yla arasını bozmak istemediği için aday gösterdiğini tahmin ediyorum."
İstanbul Büyükşehir Belediye Başkanı Ekrem İmamoğlu da Köksal’a "Ya kendine başka bir iş bulacak ya da başka parti bulacak. Öyle yok. Biz insan ayırt etmeyiz kardeşim" diyerek çıkışmıştı.